La spectrométrie de masse clinique pour la protéomique

La SM identifie le type et la quantité d'une substance présente dans un échantillon ionisé par la séparation selon la masse et la charge. La technique analytique a mis en lumière la nature des matériaux et des échantillons dans une variété de domaines, avec une application considérable dans le domaine de la protéomique. Néanmoins, l'outil ultime pour l'identification des biomarqueurs via la protéomique clinique était difficile à trouver.

Les biomolécules ont tendance à se fragiliser et se fragmenter lorsqu'elles sont ionisées. La désorption/ionisation laser assistée par matrice (MALDI) est une technique d'ionisation douce dont les procédés sont moins durs et plus adaptés à des échantillons biologiques. La MALDI MS peut mesurer les multiples analytes directement depuis les tissus intacts, dont les échantillons cliniques, sans avoir besoin de réacteurs spécifiques des cibles. Financé par l'UE, le projet EUROMALDI («Ultra high performance MALDI mass spectrometer for basic research use and clinical applications») a été lancé pour produire une plateforme protéomique pionnière.

Le partenariat rejoint un dirigeant de l'industrie mondiale du Royaume-Uni dans MALDI MS avec l'aide d'un consortium de recherche de l'université française de six équipes différentes provenant de l'université, un hôpital, et l'institut national de la santé et de la recherche médicale (INSERM). Les scientifiques optimisent l'instrumentation MALDI MS conçue par la société du Royaume-Uni pour permettre une analyse haute résolution, haut débit des protéines, des lipides et des glucides pour des applications cliniques. Le prototype abordera deux des carcinomes les plus mortels: le glioblastome (un type très invasif de tumeur maligne cérébrale et de la moelle épinière) et le cancer du pancréas.

Lors de la première période de rapport, les chercheurs ont marqué d'excellents progrès. L'équipe mettra en œuvre une MS tandem impliquant au moins deux étapes d'analyse de masse. Les chercheurs développent un logiciel de pointe pour la MS tandem et la lipidomique. Tous les composants logiciels prévus sont soit en cours d'essai ou de prototypage, et les capacités de la nouvelle plateforme MALDI MS a déjà dépassé les attentes initiales.

Le partenariat industrie-université soutenant le projet réussi EUROMALDI stimulera la position du marché de la société tout en apportant d'importants investissements au consortium de recherche universitaire grâce à un meilleur niveau à l'échelle mondiale. Qui plus est, la capacité d'identifier en temps réel en clinique la gamme de molécules de protéines, de lipides et de glucides associés à des maladies révolutionnera le diagnostic, la prévention et le traitement.