Des biomarqueurs pour les entérocolopathies inflammatoires

L'entérocolopathie inflammatoire touche environ 2 à 3 millions de personnes rien qu'en Europe, provoquant ainsi un inconfort et une souffrance considérables. Sous sa forme la plus extrême, la maladie de Crohn, elle nécessite une opération et le pronostic est souvent mauvais. Il est désormais largement accepté qu'un meilleur résultat clinique peut être obtenu à travers un diagnostic rapide et un traitement commencé suffisamment tôt.

Cela nécessite la découverte de biomarqueurs spécifiques pour diagnostiquer et stratifier les patients selon la gravité de la maladie. Gardant cela à l'esprit, les scientifiques du projet IBD-BIOM («Diagnostic and prognostic biomarkers for inflammatory bowel disease IBD-BIOM»), financé par l'UE, ont uni leurs forces pour identifier les biomarqueurs de l'entérocolopathie inflammatoire.

Basé sur un grand nombre d'échantillons précédemment mis en réserve dans des banques, le plan est d'associer des informations phénotypiques du patients avec des données -omiques. Les échantillons des patients seront analysés aux niveaux épigénétique, glycomique, glycoprotéomique et activomique. De façon épigénétique, les chercheurs espèrent identifier les changements à l'échelle du génome dans la méthylation de l'ADN associés à une expression génique altérée à différentes étapes du cours de l'entérocolopathie inflammatoire.

À l'aide d'une chromatographie liquide à haut débit et d'une technologie de spectrométrie de masse, IBD-BIOM analysera également la glycosylation des molécules plasma IgG et les reliera à l'inflammation de l'entérocolopathie inflammatoire. Les données préliminaires indiquent qu'en réponse à l'inflammation le schéma de la glycosylation IgG change. Une analyse similaire des protéines glycosylées différemment sera effectuée dans des échantillons d'intestin provenant de patients atteints d'IBD. Jusqu'à présent, un nombre de réussites liées à l'entérocolopathie inflammatoire IBD ont été identifiées et sont explorées.

Un accomplissement de projet significatif est le développement d'activomique, une nouvelle technologie établie par l'un des partenaires d'IBD-BIOM pour la découverte de biomarqueurs. L'activomique analyse les enzymes responsables des modifications post-translationnelles (phosphorylation, glycosylation ou protéolyse). Lors de l'inflammation des niveaux plus élevées de protéases sont évidents, mais on ignore encore comment cela est lié au déclenchement de l'IBD et à sa progression.

En associant les informations génétiques, épigénétiques et glycomiques, le consortium d'IBD-BIOM espère découvrir les biomarqueurs qui sont associés aux différentes étapes de l'entérocolopathie inflammatoire. Leurs activités ont été diffusées à travers un site web du projet où les vidéos de patient fournissent un témoignage supplémentaire sur la vie avec l'entérocolopathie inflammatoire.